Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms