Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACKR4Q9NPB9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms