Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms