Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XKR8Q9H6D3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms