Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms