Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms