Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFXN2Q96NB2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms