Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
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LRRIQ1Q96JM4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
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LRRIQ1Q96JM4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
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LRRIQ1Q96JM4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
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LRRIQ1Q96JM4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
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LRRIQ1Q96JM4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
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LRRIQ1Q96JM4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
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