Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCC12Q96J65 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms