Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPTQ96BT3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms