Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms