Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms