Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf40Q8IXQ3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf40Q8IXQ3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms