Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms