Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRIG3Q6UXM1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms