Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RWDD4Q6NW29 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms