Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USPL1Q5W0Q7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms