Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C9orf84Q5VXU9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9orf84Q5VXU9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms