Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1QL3Q5VWW1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms