Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWC8

HACD4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD4Q5VWC8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD4Q5VWC8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms