Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms