Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFA9Q16795 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
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