Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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HIST2H2BEQ16778 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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HIST2H2BEQ16778 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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HIST2H2BEQ16778 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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HIST2H2BEQ16778 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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HIST2H2BEQ16778 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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HIST2H2BEQ16778 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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HIST2H2BEQ16778 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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HIST2H2BEQ16778 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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HIST2H2BEQ16778 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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HIST2H2BEQ16778 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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HIST2H2BEQ16778 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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HIST2H2BEQ16778 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST2H2BEQ16778 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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