Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms