Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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CRY1Q16526 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CRY1Q16526 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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