Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRR4Q16378 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms