Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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