Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms