Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

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Length 738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF235Q14590 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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