Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE1CQ14123 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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