Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCINQ13939 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCINQ13939 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCINQ13939 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCINQ13939 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCINQ13939 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCINQ13939 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCINQ13939 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCINQ13939 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCINQ13939 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCINQ13939 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCINQ13939 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCINQ13939 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCINQ13939 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCINQ13939 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCINQ13939 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCINQ13939 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCINQ13939 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCINQ13939 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCINQ13939 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCINQ13939 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCINQ13939 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCINQ13939 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CCINQ13939 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCINQ13939 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCINQ13939 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CCINQ13939 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CCINQ13939 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CCINQ13939 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCINQ13939 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCINQ13939 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCINQ13939 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCINQ13939 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCINQ13939 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCINQ13939 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCINQ13939 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CCINQ13939 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCINQ13939 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCINQ13939 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCINQ13939 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCINQ13939 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCINQ13939 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCINQ13939 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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