Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms