Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CUL3Q13618 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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