Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRF5Q13568 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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IRF5Q13568 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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IRF5Q13568 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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IRF5Q13568 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF5Q13568 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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