Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms