Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP3B2Q13367 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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