Protein–RNA interactions for Protein: Q06481

APLP2, Amyloid-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP2Q06481 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APLP2Q06481 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms