Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF17Q02223 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms