Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms