Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3F3AP84243 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3AP84243 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3AP84243 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3AP84243 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3AP84243 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3AP84243 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3AP84243 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3AP84243 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3AP84243 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3AP84243 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3AP84243 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3AP84243 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3AP84243 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3AP84243 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3AP84243 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3AP84243 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3F3AP84243 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms