Protein–RNA interactions for Protein: P79483

HLA-DRB3, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB3P79483 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DRB3P79483 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB3P79483 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms