Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFDNP55196 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFDNP55196 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFDNP55196 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFDNP55196 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFDNP55196 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFDNP55196 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFDNP55196 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFDNP55196 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFDNP55196 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFDNP55196 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFDNP55196 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFDNP55196 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFDNP55196 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFDNP55196 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFDNP55196 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFDNP55196 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AFDNP55196 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFDNP55196 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFDNP55196 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFDNP55196 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AFDNP55196 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AFDNP55196 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AFDNP55196 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFDNP55196 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFDNP55196 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFDNP55196 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFDNP55196 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AFDNP55196 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFDNP55196 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFDNP55196 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFDNP55196 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFDNP55196 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFDNP55196 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFDNP55196 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFDNP55196 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFDNP55196 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFDNP55196 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFDNP55196 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFDNP55196 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFDNP55196 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFDNP55196 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFDNP55196 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFDNP55196 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFDNP55196 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFDNP55196 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFDNP55196 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFDNP55196 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFDNP55196 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFDNP55196 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFDNP55196 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFDNP55196 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFDNP55196 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFDNP55196 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFDNP55196 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFDNP55196 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFDNP55196 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AFDNP55196 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFDNP55196 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFDNP55196 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFDNP55196 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFDNP55196 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFDNP55196 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFDNP55196 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFDNP55196 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFDNP55196 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFDNP55196 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFDNP55196 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms