Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GEMP55040 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEMP55040 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEMP55040 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEMP55040 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEMP55040 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEMP55040 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEMP55040 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GEMP55040 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GEMP55040 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GEMP55040 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GEMP55040 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GEMP55040 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GEMP55040 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GEMP55040 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GEMP55040 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GEMP55040 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GEMP55040 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GEMP55040 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GEMP55040 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEMP55040 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEMP55040 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GEMP55040 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEMP55040 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEMP55040 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEMP55040 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEMP55040 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEMP55040 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEMP55040 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEMP55040 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEMP55040 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms