Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP53609 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms