Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT4P50991 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT4P50991 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT4P50991 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT4P50991 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT4P50991 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT4P50991 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT4P50991 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT4P50991 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT4P50991 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT4P50991 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT4P50991 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT4P50991 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT4P50991 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT4P50991 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT4P50991 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT4P50991 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT4P50991 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT4P50991 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT4P50991 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT4P50991 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT4P50991 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT4P50991 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT4P50991 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT4P50991 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms