Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RANGAP1P46060 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RANGAP1P46060 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms