Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDIT3P35638 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDIT3P35638 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDIT3P35638 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDIT3P35638 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDIT3P35638 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDIT3P35638 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DDIT3P35638 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDIT3P35638 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDIT3P35638 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDIT3P35638 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDIT3P35638 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDIT3P35638 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms