Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARID4AP29374 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms