Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHATP28329 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHATP28329 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHATP28329 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms