Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms